>ディスプレイの解像度が小さいとボタンが押せなくなると思います。

4.5.1でもサイズは変更できませんが、縦解像度768のモニタで縦幅が収まるよう配置を調整しています。
解像度が小さい場合、フォントが小さくても気にならないようでしたら環境設定で[UIのサイズ]を小さくするのがいいと思います。

4.5.1において、4.4以前でMMDテンプレートを利用して作成したデータについて、
現在のMMDテンプレートと一致するようボーン名が先端名となるよう自動変換されるようになりました。

より正確には"center end"の名前のボーンが存在していることが判定の基準になります。
ご自身でボーン名を変えてしまった場合には変換されず、また4.5.0以降で再保存したデータについてはもう変換されませんのでご注意ください。

>変更フラグの更新漏れではないでしょうか。

フラグの処理ミスでしたので、4.5.1で修正しました。

>対称編集をオンにした状態でボーンのローカルY軸(捩る)を数値入力で回転させると対称になるボーンが対称編集されないです。

4.5.1でちゃんと対称となるよう修正しました。

>オブジェクトパネルの右側がスクロールバーで隠れてしまいます。

4.5.1で縦幅が短いときもスクロールバーと重ならないようにしました。

ジンバルロックではないですが、行列・オイラー角間の変換による影響のため、X軸は-90から90度の範囲で取り扱われます。
今後のバージョンで対策を検討しています。

>openGL表示にしているとスキニングのウェイトペイントでボーンウェイトのカラー表示がされないみたいです。

頂点カラー表示自体がDirect3D9/11と大きく違っていたため、ウェイト表示も白けて表示されていました。
4.5.1で完全に同じでもないですがおおむね近い表示になりましたので実用上はこれで問題ないと思います。

xmlファイルをメールでお送りしました。
よろしくお願いします。

>すみません、念のため再度添付してみました。これで送れないとするとシステムの調子が悪いのかもしれないのですね

今度は大丈夫のようです。

内容確認したところ、GeForceをお使いのようですので、GPUのドライバーが古いままなら
新しいものを入れるとトラブルが改善するということもありますが、
以前はちゃんと動いていたということですので、これは関係ないかもしれません。

他の可能性として思いつく範囲ですと、Window Update以外で自動的にアップデートされたものがあったり、
気づかない間にマルウェアのようなものがインストールされて動作がおかしくなっているとかあたりでしょうか。

これに該当するなら、「システムの復元」で正常に動いていた２日以上前の状態に戻せば解決する可能性はあると思います。
http://121ware.com/qasearch/1007/app/servlet/relatedqa?QID=011250

あと、AppHangB1について調べる限りでは、他のアプリ・サービス等による干渉が原因でAppHangB1が発生する場合があり、
これに該当するなら、Windowsをセーフモードやクリーンブートで起動して余計なソフトを立ち上げないことで、
原因となるソフトがどれかを特定するという記載をしている記事がいくつか見つかりました。
ただ、実際にこの方法で原因を調べるのは結構大変な気はします。
（クリーンブートについて） http://answers.microsoft.com/ja-jp/windows/forum/windows_7-system/%E3%82%AF%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%83%B3/90fc9ced-7e10-4282-a0c8-93c2b36d3cad?auth=1

ご連絡ありがとうございます。
弊社Webサイトの記事にもインストール先を変更しないよう注意書きとして反映させていただきました。